正常施用有機(jī)肥不會損傷植物的根系，但更多的有機(jī)肥會灼傷根系。由于有機(jī)肥長期發(fā)酵，無機(jī)鹽含量不低，過量施肥一定會使根離子濃度過高，引起根灼傷現(xiàn)象，但不會灼傷植株。

　　由于有機(jī)肥效應(yīng)穩(wěn)定溫和，土壤溶解度變化相對緩慢，不會引起植物脫水和死亡;而且，經(jīng)過高溫分解發(fā)酵處理后，不像未經(jīng)處理的農(nóng)家肥，會嘔吐發(fā)酵，使植物的根、須腐爛。

　　應(yīng)加強(qiáng)通風(fēng)，避免空氣污染擴(kuò)散。有機(jī)肥分解過程中產(chǎn)生的氨不能揮發(fā)。因此，需要增加放氣頻率和時間，以便及時將氨氣排出大棚，避免氣害的發(fā)生。

　　增加保根肥料的施用，可以減少未成熟有機(jī)肥對根系的影響，生物菌肥等功能性肥料可以壓抑根系病害的侵染。此外，還能增加土壤有機(jī)質(zhì)含量，改善產(chǎn)品質(zhì)量，促進(jìn)光合作用，增強(qiáng)職業(yè)趨光性，植株健壯，有利于糖分的積累，延長作物的保鮮期。